Desmond Tutu var tillsammans med Nelson Mandela en av de mest namnkunniga apartheidmotståndarna.
"Ärkebiskop emeritus Desmond Tutus bortgång är ett till sorgekapitel i vårt lands avsked till en generation fantastiska sydafrikaner som efterlämnat oss ett befriat Sydafrika", säger president Cyril Ramaphosa i en kommentar.
Desmond Tutu var känd som en förespråkare för icke-våld och ordförande för den sydafrikanska sanningskommissionen efter apartheidsystemets fall. Han fick Nobels fredspris 1984 och var även hedersdoktor vid Uppsala Universitet.