Svenskarna hade med sig 1–1 från Friends arena och var tvunget att göra mål borta mot Braga.
Och Solna-klubben fick en drömstart i kvällshettan på Estadio Municipal i Portugal.
Efter knappa kvarten trädde Kristoffer Olsson in bollen till nyförvärvet Chinedu Obasi – som lånats in från kinesiska Shenzhen och gjorde sin första match sedan återkomsten. Obasi tog med sig bollen i ytan mellan två försvarare och chippade iskallt in den över Braga-målvakten.
Till förlängning
Efter paus handlade mycket om Braga. Och i den 74:e minuten kvitterade Rui Fonte – med god hjälp av AIK-målvakten Oscar Linnér.
Målvakten skulle göra ett rutiningripande och plocka upp en nickskarv från Fransérgio men fumlande med bollen – som tog en bana över honom och studsade i ryggen fram till Fonte, som enkelt stötte in 1–1 från nära håll.
Efter jättetavlan gick matchen till förlängning, och i den 121:a minuten lyckades Raúl Silva trycka in segermålet för hemmalaget efter en stökig situation i straffområdet.
"Oerhört bittert"
Domaren blåste av matchen kort senare och AIK är utslaget efter totalt 3–2 till Braga i dubbelmötet.
- Så oerhört bittert och tungt för AIK, säger kommentatorn Niklas Jarelind i Eurosports sändning.
- Efter att ha jobbat så hårt i 120 minuter... då vill man gå vidare, säger tränaren Rikard Norling till Aftonbladet.
Resultatet innebär att Östersund är enda svensklaget kvar i Europaspel.
Vilka som möts i playoff, sista rundan före gruppspelet, lottas på fredagen. Östersund slog ut Fola Esch från Luxemburg med sammanlagt 3–1.